Offre de Stage

Titre: Traitement numérique du signal et segmentation de l'image tumorale

Lieu: équipe d’imagerie moléculaire du département de recherche en oncologie de Sanofi-Aventis (Centre de Recherche de Vitry sur seine)

Durée: 6 mois

Indemnité: environ 1000 euros/mois

Contact: Manoel Nunes soit par téléphone au 0158933413, soit par e-mail : manoel.nunes@sanofi-aventis.com


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Description:

Introduction
La tumeur :
Une tumeur est caractérisée par son origine, ses caractéristiques tissulaires (cellules différenciées/en différenciation, angiogenèse, nécrose), son état (circonscrit ou non) et ses paramètres de croissance (vitesse, focalisation/généralisation). Ces caractéristiques évolutives sont prises en compte au moment du diagnostic ainsi que pour le suivi et l’évaluation de l’efficacité d’un traitement.

L’imagerie moléculaire :
L’imagerie moléculaire regroupe un ensemble de techniques qui permettent, in vivo et de manière non invasive, de visualiser et de caractériser à l’échelle cellulaire ou moléculaire des processus biologiques fondamentaux dans l’évolution des maladies. Ces techniques ouvrent la possibilité de faire un diagnostic de plus en plus précoce et précis, et viennent en complément de l’imagerie traditionnelle fondée sur l’analyse morphologique des tissus. Afin de mieux comprendre les processus biologiques, il est important de pouvoir décomposer et quantifier les informations obtenues par les différentes techniques d’imagerie (Echographie ultrasonore, Tomographie par Emission de Positron, Bioluminescence…).

Objectif :
Les données brutes fournies par les instruments d’imagerie sont disponibles en format DICOM et peuvent être gérées sous Matlab®. L’objectif de ce projet sera d’adapter et de développer des méthodes numériques de traitement du signal et de l’image sous Matlab® pour mieux caractériser les modèles tumoraux et leurs réponses à une thérapie.

Méthodologie :
Le traitement numérique des signaux ou des images pourra s’orienter selon plusieurs axes : 
Amélioration de l’image : l’acquisition des données est généralement perturbée par la présence d’un bruit de fond. Une première étape du projet consistera à diminuer ce bruit en appliquant les algorithmes de filtrage les plus pertinents en fonction de la modalité d’imagerie considérée. Des algorithmes permettant une amélioration de la distinction des formes et de la netteté des contours pourront aussi être mis en place.
Segmentation : une segmentation automatique pourra être implémentée au cours de ce projet permettant la définition rapide de régions d’intérêt particulier.
Analyse des données : des méthodes d’analyse des données devront être mises en place afin de caractériser et comparer les régions d’intérêt (analyse des valeurs, histogramme, texture…).

Durée du stage et localisation : 

Ce stage sera effectué dans l’équipe d’imagerie in vivo rattachée à la section de pharmacologie expérimentale du département de recherche en oncologie de Sanofi-Aventis (Centre de Recherche de Vitry sur seine) pour une durée de 6 mois.